통합고용세액공제, 어떤 직원이 유리한가 (2026)

세무법인 호안 작성 · 검수 김해인 세무사 · 최종 검수일 2026-09-21 · 2026년 7월 기준 세법으로 작성되었습니다.

직원을 채용했을 때 세금을 돌려받는 관건은 채용 그 자체가 아니라 연평균 상시근로자 수가 늘었는지입니다. “직원을 뽑았으니 세금이 알아서 줄겠지”라고 넘기기 쉽지만, 현장에서는 사람을 늘리고도 요건을 놓쳐 공제를 받지 못하거나, 공제 후 인원이 줄어 남은 연차의 혜택을 놓치는 일이 벌어집니다. 여기에 어떤 직원을 어느 지역에서 채용했는지가 더해져 공제액이 정해지므로, 판단 순서대로 정리했습니다.

통합고용세액공제는 무엇을 돌려주는가

늘어난 인건비의 일부를 세금으로 되돌려주는 제도입니다. 2025년 12월 23일 개정(2026년 1월 1일 시행)으로 2026~2028년 과세연도에는 매년 그 해의 연평균 상시근로자 수를 직전·전전·전전전 과세연도(2025년 1월 1일 이후 개시한 과세연도만 해당)와 각각 비교해, 늘어난 인원 1명당 연차별 단가를 곱한 금액을 법인세(소득세)에서 공제합니다. 종전의 ‘1명당 정액을 3년간 매년 공제’ 방식은 2025년 이전 개시 과세연도분까지만 적용됩니다.

어떤 직원을 채용해야 세금 혜택이 큰가

기본은 근로계약기간 1년 이상 근로자입니다. 다만 1년 이상 계약이라도 아래에 해당하면 공제 대상 인원에서 빠집니다.

• 단시간 근로자 — 다만 「해당 과세연도 총 근로시간 ÷ 근무개월 수」로 계산한 월 평균 근로시간이 60시간 이상이면 상시근로자에 포함됩니다. 이때 1명이 아니라 0.5명으로 세고, 기간의 정함이 없는 근로계약·차별 처우 없음·시간당 임금이 최저임금의 120%(중소기업) 이상 등의 요건을 갖추면 0.75명으로 계산합니다
• (법인) 임원, 최대주주와 그의 가족
• (개인사업자) 대표자 및 그의 가족
• 근로소득세 원천징수 이력이 없거나, 국민연금·직장가입자 건강보험료 납부 이력이 없는 자

여기에 더해 청년·장애인·고령자·경력단절근로자를 채용하면 같은 한 명이라도 더 큰 ‘청년등’ 단가가 적용됩니다. 우대 대상 기준은 다음과 같습니다.

• 청년: 15세 이상 34세 이하(병역을 이행했다면 그 기간을 6년 한도로 빼고 계산). 다만 기간제·단시간·파견근로자와 청소년유해업소에 근무하는 청소년은 청년 대상에서 빠집니다. 근로계약을 맺을 당시 34세 이하였다면 그 뒤 34세를 넘겨도 계약일부터 4년간은 청년으로 봅니다. 다만 이 4년 간주에는 시점 제한이 둘 있습니다 — ①2025년 1월 1일부터 12월 31일까지 체결한 근로계약은 3년간이고(시행령 부칙 2026-02-27 대통령령 제36127호 제11조제2항), ②2026년을 최초 공제연도로 신청하는 경우 2024년에 체결한 근로계약에는 이 간주가 적용되지 않습니다(국세청 사전-2026-법규법인-0729). 이 글의 비교 기준연도가 2025년이라 ①에 해당하는 채용이 많습니다
• 장애인: 장애인복지법의 적용을 받는 장애인뿐 아니라 국가유공자법상 상이자, 5·18민주화운동부상자, 그리고 장애등급 판정을 받은 고엽제후유의증환자도 포함합니다 (연령 요건은 없습니다)
• 고령자: 근로계약 체결일 현재 만 60세 이상 (조문이 판정 시점을 근로계약 체결일로 정하므로 재직 중 60세에 도달한 경우는 해당하지 않고, 정년퇴직으로 근로관계가 실질적으로 단절된 뒤 새 근로계약을 맺었다면 그 체결일로 다시 판정합니다)
• 경력단절근로자(남성도 가능 — 2025년 1월 1일 이후 개시하는 과세연도를 최초 공제연도로 하여 신청하는 경우부터입니다. 2024년 12월 31일 이전에 개시하는 과세연도에 고용했다면 종전 규정이 적용됩니다): 같은 기업에서 1년 이상 근무한 뒤 결혼·임신·출산·육아·자녀교육·가족돌봄 사유로 퇴직하고, 퇴직일부터 2년 이상 15년 미만이 지난 자(최대주주 등 특수관계인은 제외)

채용만 하면 세금 혜택을 받을 수 있는가

그렇지는 않습니다. 직전 3개 과세연도 중 1개 이상(2025년 1월 1일 이후 개시한 과세연도만 해당)보다 연평균 상시근로자 수가 증가해야만 공제가 됩니다. 2026년 과세연도에는 비교할 수 있는 연도가 2025년뿐이므로 사실상 전년도와 비교합니다. 퇴사자를 대체하려고 새로 뽑았다면 순인원이 늘지 않아, 채용 사실만으로는 공제를 받지 못합니다.

직원 1명을 뽑으면 연평균 상시근로자 수는 입사 후 연말까지 근속한 개월 수에 따라 달라집니다.

• 5월에 1명 채용 → 0.66명 증가(8개월/12개월)
• 12월에 1명 채용 → 0.08명 증가(1개월/12개월)

즉, 한 명을 뽑아도 연평균으로는 1명이 아니라 그 해 근속한 개월 수의 비율만큼만 늘어납니다.

얼마나 공제받을 수 있는가 — 중소기업 기준

늘어난 연평균 상시근로자 1명당 공제액은 채용한 근로자 유형과 회사 소재지, 그리고 어느 연도와 비교해 늘었는지에 따라 달라집니다. 신규 채용 외에 육아휴직 복귀도 추가 공제 대상입니다.

1) 정규직 직원을 추가 채용해 인원이 늘어난 경우

매년 그 과세연도의 연평균 인원을 직전·전전·전전전 연도와 각각 비교해, 비교 연도별로 늘어난 인원 1명당 아래 단가를 곱한 금액을 공제합니다. 인원을 유지하면 같은 증가분이 다음 해에는 ‘전전 대비’, 그다음 해에는 ‘전전전 대비’로 이어지며 단가가 커지는 구조입니다.

1명당 단가(중소기업)	직전 연도 대비 증가	전전 연도 대비 증가	전전전 연도 대비 증가
청년등(청년·장애인·고령자·경력단절근로자 등)	수도권 700만원 / 수도권 밖 1,000만원	수도권 1,600만원 / 수도권 밖 1,900만원	수도권 1,700만원 / 수도권 밖 2,000만원
청년등 외 상시근로자	수도권 400만원 / 수도권 밖 700만원	수도권 900만원 / 수도권 밖 1,200만원	수도권 1,000만원 / 수도권 밖 1,300만원

같은 채용이라도 이렇게 달라집니다 (수치 대비 · 전제: 수도권 밖 중소기업이 2026년에 청년 상시근로자 1명 증가, 2028년까지 인원 유지)

• 2026년: 직전(2025년) 대비 1명 증가 × 1,000만원 = 1,000만원 공제
• 2027년: 직전(2026년) 대비 증가 없음(0원) + 전전(2025년) 대비 1명 증가 × 1,900만원 = 1,900만원 공제
• 2028년: 전전전(2025년) 대비 1명 증가 × 2,000만원 = 2,000만원 공제 → 3년 합계 4,900만원

한편 2025년 이전에 종전 규정(‘1명당 정액을 3년간 공제’)으로 공제를 시작한 증가분은 경과조치가 정하고 있습니다. 2024년 또는 2025년 12월 31일이 속하는 과세연도에 상시근로자 수가 직전 과세연도보다 늘었다면, 그 과세연도와 종료일부터 2년(중소·중견기업)이 되는 날이 속하는 과세연도까지는 공제와 추징 모두 종전 규정을 따릅니다(부칙 2025-12-23 법률 제21223호 제34조).

2) 육아휴직자를 복귀시킨 경우

1년 이상 근무한 직원이 연속 6개월 이상 육아휴직 후 복귀하면, 복귀 인원 1명당 1,300만원을 추가로 공제받습니다(직전연도보다 연평균 상시근로자 수가 줄지 않은 경우에 한함). 이 공제는 2026년 12월 31일까지 복직시키는 경우까지이고, 자녀 1명당 한 차례만 적용됩니다.

고용을 늘린 기업에 다른 혜택은 없는가

세금 공제로 끝이 아닙니다. 고용을 늘릴 계획이 있는 기업에는 특정 연도의 정기 세무조사 면제 혜택이 주어지기도 합니다. 다만 이는 법령에 정해진 제도가 아니라 국세청이 세정지원 차원에서 운영하는 행정 혜택이므로, 적용 여부와 요건은 그 해의 국세청 운영 기준을 확인해야 합니다.

정리 — 통합고용세액공제는 무엇부터 준비하는가

통합고용세액공제의 핵심은 채용이 아니라 연평균 상시근로자 수의 증가입니다. 청년·경력단절근로자 등을 수도권 밖에서 채용해 인원을 유지하면 연차별 단가(1명당 최대 2,000만원)로 3년에 걸쳐 공제가 이어지고, 인원이 줄면 그 해 공제가 0이 되므로 유지 관리까지 설계해야 합니다.

자주 묻는 질문

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